60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1559 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  100 
 
 		 266 aa  543  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  73.21 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  62.93 
 
 		 264 aa  321  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  59.92 
 
 		 263 aa  318  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  62.16 
 
 		 265 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  56.6 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  48.25 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  43.14 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  48.4 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  46.4 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  42.23 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  42.08 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  42.8 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  42.8 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  42.8 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  42.75 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  41.11 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  40.38 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  40.32 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  40.62 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  38.74 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  32.03 
 
 		 271 aa  89  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  32.68 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  33.85 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  34.39 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  33.07 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  33.07 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  33.2 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  28.78 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  32.8 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  32.41 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  32.8 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  31.73 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  36.36 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.4 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  28.79 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  28.74 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  27.49 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  31.6 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  26.21 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  28 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  27.51 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  27.14 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  27.14 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  27.41 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  28.2 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  26.02 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.36 
 
 		 599 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  29.64 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  25.49 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  27.45 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  28.96 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  28.99 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  30.2 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  30.99 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  27.72 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  26.82 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>