More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3731 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  93.94 
 
 		 144 aa  253  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  75.38 
 
 		 147 aa  206  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.59 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.86 
 
 		 148 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 		 149 aa  168  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.42 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 155 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 155 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 151 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  53.95 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.28 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.68 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.24 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 149 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.74 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  51.01 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.58 
 
 		 146 aa  154  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5722  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  51.68 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  48.99 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 150 aa  150  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.68 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.69 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1719  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0301155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.14 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  51.82 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 143 aa  148  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.32 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.8 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>