58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2670 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  86.49 
 
 		 681 aa  1235    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1380    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  52.28 
 
 		 693 aa  676    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  40.18 
 
 		 679 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2171  GTP-binding protein  36.94 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1829  hypothetical protein  36.94 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0052  hypothetical protein  37.21 
 
 		 419 aa  194  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.115032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1068  hypothetical protein  31.46 
 
 		 410 aa  188  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  30.86 
 
 		 418 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  31 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  31.21 
 
 		 418 aa  183  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  32.15 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00830  hypothetical protein  32.71 
 
 		 380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2359  GTP-binding protein  33.33 
 
 		 410 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.609724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0513  hypothetical protein  36.02 
 
 		 490 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  31 
 
 		 419 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0051  hypothetical protein  33.24 
 
 		 419 aa  174  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  30.91 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  30.91 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  30.91 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  30.91 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  30.56 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2056  hypothetical protein  34.11 
 
 		 540 aa  170  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00919079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  30.68 
 
 		 619 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  30.68 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  30.24 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  30.24 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  30.24 
 
 		 504 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0026  hypothetical protein  29.22 
 
 		 607 aa  148  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0048296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2402  hypothetical protein  30.56 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0964182  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2182  hypothetical protein  29.47 
 
 		 666 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1139  hypothetical protein  31.93 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000332623  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0164  hypothetical protein  29.97 
 
 		 614 aa  127  8.000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000289397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5916  hypothetical protein  29.77 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0573  hypothetical protein  36.84 
 
 		 479 aa  91.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  28.44 
 
 		 1380 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  29.51 
 
 		 1202 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  37.74 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.19 
 
 		 1710 aa  64.3  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0852  hypothetical protein  29.43 
 
 		 633 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  26.17 
 
 		 2474 aa  57.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.62 
 
 		 753 aa  54.3  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.94 
 
 		 812 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0911  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.15 
 
 		 632 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0440438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.64 
 
 		 966 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.27 
 
 		 633 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  30.04 
 
 		 773 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  29.11 
 
 		 718 aa  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1171  hypothetical protein  34.44 
 
 		 202 aa  51.6  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  25.64 
 
 		 804 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  39.24 
 
 		 1087 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 		 1489 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 777 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  35.57 
 
 		 1514 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 865 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1082 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.4 
 
 		 2073 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.48 
 
 		 1512 aa  44.3  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>