More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1256 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  100 
 
 
248 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  91.8 
 
 
244 aa  448  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  54.36 
 
 
240 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  45.04 
 
 
366 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  57.93 
 
 
356 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  43.16 
 
 
368 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  45.38 
 
 
266 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  43.75 
 
 
372 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  42.19 
 
 
385 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  42.35 
 
 
386 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  42.06 
 
 
425 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  43.59 
 
 
389 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  45.34 
 
 
389 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  43.5 
 
 
373 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  46.22 
 
 
381 aa  168  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  42.26 
 
 
373 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  41.46 
 
 
368 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  43.16 
 
 
372 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  40.49 
 
 
380 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  42.11 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  42.68 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  40.66 
 
 
390 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  41.46 
 
 
386 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  41.46 
 
 
386 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.14 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  51.11 
 
 
323 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  41.56 
 
 
397 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  39.83 
 
 
374 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  54.25 
 
 
176 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  54.55 
 
 
323 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  41 
 
 
483 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  40.24 
 
 
385 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  51.32 
 
 
357 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  56.33 
 
 
228 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  50.3 
 
 
233 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.66 
 
 
234 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  51.9 
 
 
233 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.12 
 
 
242 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.18 
 
 
250 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.19 
 
 
233 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  35.59 
 
 
367 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  50 
 
 
242 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  49.72 
 
 
233 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  52.5 
 
 
376 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  47.03 
 
 
235 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  51.76 
 
 
388 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  52.63 
 
 
338 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.92 
 
 
242 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  50.3 
 
 
230 aa  148  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  45.71 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  48.31 
 
 
340 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  50 
 
 
243 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  46.75 
 
 
225 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.59 
 
 
235 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.24 
 
 
230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  46.36 
 
 
216 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  40.71 
 
 
342 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  40.41 
 
 
363 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  48.41 
 
 
230 aa  141  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  47.74 
 
 
318 aa  141  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  49.06 
 
 
313 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  46.67 
 
 
370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  38.78 
 
 
398 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  42.93 
 
 
385 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  35.63 
 
 
385 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.06 
 
 
233 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  44.74 
 
 
306 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  36.5 
 
 
316 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  42 
 
 
360 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  44.92 
 
 
306 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  42.77 
 
 
421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  40.43 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  43.9 
 
 
433 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  44.64 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  38.11 
 
 
402 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  41.67 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  33.46 
 
 
281 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.35 
 
 
353 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  30.74 
 
 
265 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  41.07 
 
 
402 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  37.62 
 
 
372 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  34.04 
 
 
382 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  35 
 
 
395 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.3 
 
 
341 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.59 
 
 
345 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  30.47 
 
 
526 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  40.61 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  30.65 
 
 
386 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  40.76 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  36.9 
 
 
341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.09 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  38.03 
 
 
365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  40.76 
 
 
341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  34.57 
 
 
345 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  43.48 
 
 
339 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  43.48 
 
 
315 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  43.48 
 
 
343 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  40.37 
 
 
340 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  43.48 
 
 
343 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  44.24 
 
 
356 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>