172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1337 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  100 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  81.6 
 
 		 207 aa  332  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  80.19 
 
 		 207 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  56.36 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  51.19 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  55.09 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  52.27 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  48.89 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  46.11 
 
 		 181 aa  147  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  45.4 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.83 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  45 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  56.38 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.19 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.99 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.99 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.75 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.96 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  56.08 
 
 		 407 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  43.02 
 
 		 184 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  47.09 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.44 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.51 
 
 		 191 aa  131  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  46.51 
 
 		 191 aa  131  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  46.51 
 
 		 191 aa  131  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.51 
 
 		 191 aa  131  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.51 
 
 		 191 aa  131  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.51 
 
 		 191 aa  131  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.51 
 
 		 191 aa  131  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.91 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  46.51 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  56.43 
 
 		 172 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  45.83 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  36.42 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  39.56 
 
 		 197 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40 
 
 		 171 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0882  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2790  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  41.61 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  37.87 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4350  NADPH-dependent FMN reductase  40.79 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  40.14 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  36.87 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  43.7 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  35.75 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  39.34 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  35.75 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  36.91 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  36.81 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  38.2 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  34.32 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  37.11 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  35.95 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  35.39 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  48.15 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  41.82 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  45.37 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  35.14 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  34.83 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  34.83 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  44.09 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  43.01 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  36.61 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  37.29 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  34.66 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  34.84 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  38.64 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  30.67 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  42.22 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  32.03 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  25.49 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  25.49 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  39.58 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  33.57 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  33.91 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  31.02 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  41.25 
 
 		 481 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1978  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.789371  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  32.75 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  31.02 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  37.41 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1328  hypothetical protein  34.81 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.35673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>