225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3936 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  100 
 
 
283 aa  554  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  98.59 
 
 
283 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  39.33 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  42.49 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  39.79 
 
 
291 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  41.67 
 
 
282 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  40.75 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  40.75 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  40.75 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  41.13 
 
 
282 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  40.89 
 
 
282 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  40.89 
 
 
282 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  35.25 
 
 
284 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  35.38 
 
 
290 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.46 
 
 
283 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  39.5 
 
 
293 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  24.74 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  29.21 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  26.39 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  35.29 
 
 
163 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  25.26 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.8 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  25.69 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  23.51 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.46 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0471  ATP synthase F1, H+-transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.05 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0106314  normal  0.135636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  29.07 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  26.05 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  24.2 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  30.91 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0844  ATP synthase F1, gamma subunit  25.09 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  22.53 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  30.08 
 
 
306 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.55 
 
 
291 aa  58.9  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.8 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  22.77 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.66 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  24.51 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.27 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1274  ATP synthase F1, gamma subunit  22.91 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.145072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1180  ATP synthase F1, gamma subunit  22.91 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.30145  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0507  ATP synthase F1, gamma subunit  23.65 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.56 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  24.16 
 
 
306 aa  55.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  19.67 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl114  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.01 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.49 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.08 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.08 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.08 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.49 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.08 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.07 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.03 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.75 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.67 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  23.62 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.07 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.031727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.22 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  24.91 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.22 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.22 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  22.26 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.92 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.92 
 
 
290 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.91 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.13 
 
 
282 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.22 
 
 
298 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1526  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000258594  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.97 
 
 
294 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  23.47 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  23.18 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.32 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.2 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  27.95 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  22.41 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.52 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  29.71 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.85 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  22.22 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.42 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  24.04 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.21 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.32 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.92 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.73 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  25.84 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  20.45 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  26.92 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  23.33 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.26 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.26 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.88 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.26 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.73 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.73 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>