87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2562 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  100 
 
 		 326 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  98.16 
 
 		 326 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  83.13 
 
 		 326 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  47 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 		 316 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  45.15 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  45.64 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 		 305 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 		 306 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  30.1 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  34.5 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  32.53 
 
 		 642 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.05 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.71 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  25.7 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  27.63 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.42 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.42 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 528 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  26.49 
 
 		 1041 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.63 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 460 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 623 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.63 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  25.5 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.56 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.48 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.64 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  30.4 
 
 		 754 aa  46.2  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 748 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 		 753 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 637 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2946  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.765894  normal  0.180956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.14 
 
 		 1132 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  33.05 
 
 		 501 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  23.21 
 
 		 281 aa  43.1  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4197  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  26.75 
 
 		 315 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 466 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.63 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>