160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1683 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 
142 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  98.59 
 
 
142 aa  268  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  78.87 
 
 
142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  56.3 
 
 
162 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  55.64 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  47.83 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  40.44 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  53.61 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  47.62 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  44.04 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  41.18 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  44.74 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  40.83 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  40.34 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  45.19 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  46.23 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  51.46 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  40.15 
 
 
352 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  46.49 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  51.92 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  40.48 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  45.32 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  40.71 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  41.27 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0951  HPr kinase/phosphorylase  40.52 
 
 
316 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  42.59 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  39.53 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  39.72 
 
 
318 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  42.59 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  39.01 
 
 
316 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  40.43 
 
 
318 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  40.43 
 
 
318 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  40.43 
 
 
318 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  39.23 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  38.89 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  37.93 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  40.43 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  38.3 
 
 
316 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  38.79 
 
 
316 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  40 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  43.37 
 
 
307 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  43.37 
 
 
307 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  43.27 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02224  HPr kinase/phosphorylase  39.66 
 
 
316 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.375894  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  38.46 
 
 
328 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  36.59 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  40.52 
 
 
318 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  32.11 
 
 
310 aa  62.8  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  39.42 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0668  HPr kinase/phosphorylase  39.47 
 
 
316 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  39.45 
 
 
310 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  39.45 
 
 
310 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0754  HPr kinase/phosphorylase  39.47 
 
 
316 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.46702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  36.57 
 
 
319 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  41 
 
 
320 aa  62  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  39.52 
 
 
311 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  45.57 
 
 
312 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  44.87 
 
 
319 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  41.84 
 
 
309 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  39.45 
 
 
310 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  37.8 
 
 
311 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  44.44 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.61 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  38.06 
 
 
325 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  39.47 
 
 
315 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  44.44 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  39.81 
 
 
310 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.81 
 
 
310 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>