222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0639 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  100 
 
 
558 aa  1144    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  99.82 
 
 
558 aa  1142    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.93 
 
 
544 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.68 
 
 
582 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  37.52 
 
 
578 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.27 
 
 
580 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.38 
 
 
515 aa  343  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.44 
 
 
577 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.62 
 
 
577 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.79 
 
 
527 aa  322  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.43 
 
 
528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  35.61 
 
 
566 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.09 
 
 
519 aa  309  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.59 
 
 
594 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37 
 
 
575 aa  303  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.76 
 
 
541 aa  300  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.16 
 
 
577 aa  299  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  34.57 
 
 
640 aa  296  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.14 
 
 
582 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.75 
 
 
564 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.98 
 
 
524 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.21 
 
 
601 aa  286  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.33 
 
 
616 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.31 
 
 
531 aa  279  9e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.51 
 
 
562 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.3 
 
 
512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.5 
 
 
529 aa  274  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.21 
 
 
513 aa  270  4e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.22 
 
 
539 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.57 
 
 
585 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.6 
 
 
510 aa  267  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  35.76 
 
 
537 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  34.77 
 
 
563 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1391  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.77 
 
 
517 aa  263  4e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.251897  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.79 
 
 
556 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.15 
 
 
579 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.01 
 
 
534 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  32.16 
 
 
585 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.16 
 
 
557 aa  257  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  33.54 
 
 
574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.74 
 
 
513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  33.4 
 
 
565 aa  253  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.97 
 
 
514 aa  252  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34 
 
 
589 aa  250  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.18 
 
 
681 aa  249  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.66 
 
 
657 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.14 
 
 
514 aa  243  6e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.04 
 
 
515 aa  243  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  31.71 
 
 
671 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  30.03 
 
 
674 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  33.33 
 
 
579 aa  240  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.73 
 
 
517 aa  240  5e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.66 
 
 
511 aa  239  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  35.21 
 
 
845 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.57 
 
 
629 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.34 
 
 
586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.06 
 
 
597 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.05 
 
 
564 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.04 
 
 
597 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.32 
 
 
598 aa  230  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.72 
 
 
628 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.26 
 
 
587 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  32.74 
 
 
577 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.69 
 
 
583 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.14 
 
 
584 aa  220  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.36 
 
 
645 aa  219  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.19 
 
 
1258 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  28.27 
 
 
647 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.13 
 
 
561 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.37 
 
 
521 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29 
 
 
645 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.12 
 
 
1212 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.2 
 
 
548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  31.24 
 
 
548 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.81 
 
 
670 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.82 
 
 
632 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.04 
 
 
634 aa  213  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4046  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.13 
 
 
559 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  decreased coverage  0.00136288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.8 
 
 
568 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.73 
 
 
599 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.37 
 
 
1211 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6440  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.71 
 
 
1220 aa  210  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  30.62 
 
 
551 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.65 
 
 
708 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.17 
 
 
660 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.65 
 
 
708 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  29.77 
 
 
581 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.07 
 
 
1242 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.06 
 
 
561 aa  204  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  29.95 
 
 
581 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  28.97 
 
 
613 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.83 
 
 
572 aa  203  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.99 
 
 
775 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  28.99 
 
 
1277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7017  hydantoin utilization protein  28.9 
 
 
571 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.01 
 
 
629 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.55 
 
 
519 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.11 
 
 
589 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.14 
 
 
646 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  28.5 
 
 
611 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>