196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02069 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  44.51 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  41.14 
 
 		 342 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  41.14 
 
 		 342 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  41.14 
 
 		 329 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  45.66 
 
 		 344 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  41.62 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  41.32 
 
 		 332 aa  216  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  39.18 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  44.98 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  39.07 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  40.67 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.46 
 
 		 354 aa  205  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  40.98 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  41.03 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  41.76 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  41.35 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  39.18 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  40.98 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  40.52 
 
 		 353 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  42.18 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  34.72 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  38.28 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.64 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  43.02 
 
 		 336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  37.59 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  33.72 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  33.72 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  33.72 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  43.32 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  33.72 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  38.82 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  39.39 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  42.42 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  34.15 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  32.85 
 
 		 324 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  41.05 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  38.44 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  39.85 
 
 		 329 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  34.89 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  34.56 
 
 		 335 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  34.58 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  39.56 
 
 		 335 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  39.12 
 
 		 356 aa  185  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  35.08 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  41.18 
 
 		 357 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  35.17 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.22 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.19 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  37.33 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.82 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.22 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  41.77 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  39.16 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.04 
 
 		 376 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  41.37 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  37.42 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  36.99 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  38.11 
 
 		 398 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  35 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  37.76 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  34.58 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  38.73 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  38.24 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  40.29 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.51 
 
 		 374 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  40.56 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  36.39 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  40.16 
 
 		 372 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.8 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.31 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  37.86 
 
 		 372 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  37.86 
 
 		 372 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  37.86 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  39.82 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  35.41 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  36.39 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.98 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  34.37 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.97 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  33.52 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.85 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  38.29 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  32.98 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  35.83 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  35.83 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  34.06 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03132  Zn-dependent hydrolase/oxidoreductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13010)  31.02 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.131518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.8 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  36.46 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  38.33 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  35.66 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  36.53 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.04 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>