43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3679 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3679  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1816  hypothetical protein  88.26 
 
 		 218 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3921  hypothetical protein  93.06 
 
 		 217 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0634147  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4248  hypothetical protein  80.37 
 
 		 219 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0519  hypothetical protein  73.15 
 
 		 215 aa  328  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6560  hypothetical protein  78.64 
 
 		 220 aa  322  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3377  hypothetical protein  72.69 
 
 		 215 aa  305  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4839  hypothetical protein  56.12 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  0.0189863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1690  hypothetical protein  56.12 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3487  hypothetical protein  54.71 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1571  hypothetical protein  51.47 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1541  hypothetical protein  51.47 
 
 		 209 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1598  hypothetical protein  51.23 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0278504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3338  hypothetical protein  47.93 
 
 		 215 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2608  hypothetical protein  49.75 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1808  hypothetical protein  52.55 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1715  hypothetical protein  52.55 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1528  hypothetical protein  52.55 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.087635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3081  hypothetical protein  48.5 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4036  hypothetical protein  51.53 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2530  hypothetical protein  52.48 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2173  hypothetical protein  47.55 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3529  hypothetical protein  51.38 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1019  hypothetical protein  48.78 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1020  hypothetical protein  43.07 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.371436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2211  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0657  hypothetical protein  39.2 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206149  normal  0.728509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0063  hypothetical protein  35.78 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.917122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0097  hypothetical protein  35.78 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3050  hypothetical protein  34.8 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1741  hypothetical protein  31.66 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0433595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1206  hypothetical protein  40.15 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.386707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3805  hypothetical protein  33.93 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0985761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2438  hypothetical protein  31.22 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1470  hypothetical protein  34.09 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0384099  normal  0.0350114 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3517  hypothetical protein  31.55 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.929762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3825  hypothetical protein  31.55 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.404988  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4504  hypothetical protein  33.56 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0520  hypothetical protein  29.32 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0343  hypothetical protein  22.5 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0664  hypothetical protein  27.01 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4682  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 424 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4538  histidine kinase  28.85 
 
 		 417 aa  41.6  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>