75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2005 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  39.13 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  38.82 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  38.04 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  34.23 
 
 		 465 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  38.57 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  46.15 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  28.62 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  28.62 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  29.85 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  32.68 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  32.68 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  34.87 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  37.91 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  39.11 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  36.55 
 
 		 627 aa  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  40.5 
 
 		 520 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  33.56 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  35.98 
 
 		 464 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  34.27 
 
 		 446 aa  109  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  32.12 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  34.14 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  35.85 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  36.32 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  37.99 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  33.02 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  31.09 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  38.02 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  42.6 
 
 		 486 aa  99.8  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  37.07 
 
 		 465 aa  99.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  38.07 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  27.09 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  36.32 
 
 		 449 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  36.51 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  29.59 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  35.02 
 
 		 527 aa  95.9  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  33.2 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  41.07 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  34.87 
 
 		 436 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  29.6 
 
 		 427 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  37.84 
 
 		 436 aa  85.9  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  29.6 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  32.73 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  33.18 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  28.75 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  30.93 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  29.44 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  34.16 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  28.41 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  32.72 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  35.1 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  32.26 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  32.2 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  32.11 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  32.72 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  29.13 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  35.29 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  29.95 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  29.44 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  28.3 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  27.96 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  29.48 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  29.84 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  27.13 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  27.13 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  27.13 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  29.02 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  25.59 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  33.86 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  32.26 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  26.45 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.632999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>