85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2300 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  815    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  60.14 
 
 
429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  57.45 
 
 
427 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  51.64 
 
 
438 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  50.63 
 
 
438 aa  360  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  52.49 
 
 
430 aa  353  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  51.54 
 
 
430 aa  342  7e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  41.9 
 
 
430 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  46.86 
 
 
449 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  44.62 
 
 
442 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  43.45 
 
 
502 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  45.13 
 
 
450 aa  273  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  42.35 
 
 
354 aa  236  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  40.85 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3127  hypothetical protein  33.18 
 
 
476 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  30.96 
 
 
345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  30.74 
 
 
352 aa  124  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  29.18 
 
 
334 aa  120  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  27.27 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  27.8 
 
 
332 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  25.27 
 
 
335 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  27.63 
 
 
335 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  32.99 
 
 
520 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  29.89 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  27.88 
 
 
348 aa  94  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  94  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  30.42 
 
 
331 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  29.55 
 
 
456 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  31.06 
 
 
312 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  27.31 
 
 
465 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  27.74 
 
 
337 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  37.3 
 
 
531 aa  90.1  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  30.56 
 
 
326 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  27.74 
 
 
337 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  32.38 
 
 
338 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  26.46 
 
 
335 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  38.96 
 
 
371 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  26.46 
 
 
335 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  30.6 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  30.77 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  30.77 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  28.83 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  30.6 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  33.67 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  28.71 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  30.17 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  25.15 
 
 
627 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  25.96 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  29.79 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  34.67 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  29.86 
 
 
446 aa  77  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  29.37 
 
 
546 aa  76.6  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  29.85 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  29.85 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  24.58 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  30.61 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  29.67 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  23.93 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  33.87 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  28.02 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  27.18 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  30 
 
 
539 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  29.85 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  38.22 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  29.22 
 
 
315 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  30.53 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  32.02 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  25.1 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  24.71 
 
 
434 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  34.97 
 
 
436 aa  67  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  26.45 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  34.29 
 
 
323 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  35.06 
 
 
344 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  31.98 
 
 
486 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0618  hypothetical protein  26.69 
 
 
274 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1964  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.386343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1190  hypothetical protein  27.59 
 
 
324 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  30.72 
 
 
322 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  26.88 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0875  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  24.5 
 
 
330 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0724  hypothetical protein  25 
 
 
322 aa  46.6  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00775573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1424  hypothetical protein  26.56 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.924519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>