63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1136 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  100 
 
 
315 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  62.21 
 
 
312 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  51.34 
 
 
308 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  51.34 
 
 
307 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  51.34 
 
 
307 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  50.71 
 
 
309 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  49.34 
 
 
323 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0618  hypothetical protein  47.71 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1964  hypothetical protein  46.18 
 
 
310 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.386343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3772  hypothetical protein  47.2 
 
 
309 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1190  hypothetical protein  43.51 
 
 
324 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  44.01 
 
 
322 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  29.66 
 
 
427 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0875  hypothetical protein  34.41 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  28.57 
 
 
429 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  26.32 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  27.31 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  28.19 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  38.35 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  27.23 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  26.26 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  30.81 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  27.84 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  29.17 
 
 
431 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  27.54 
 
 
456 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  25.38 
 
 
354 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  26.16 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  24.56 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  26.39 
 
 
430 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  32.35 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  25.13 
 
 
627 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  24.72 
 
 
520 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  23 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  26.64 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  27.69 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  25.45 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  30.2 
 
 
465 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  26.24 
 
 
531 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  24.76 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3127  hypothetical protein  28.09 
 
 
476 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  24.76 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  27.51 
 
 
338 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  27.01 
 
 
341 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  29.88 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  26.79 
 
 
435 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  28.06 
 
 
430 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  26.99 
 
 
440 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  28.42 
 
 
344 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  28.21 
 
 
502 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  21.59 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  25.95 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  23.6 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  23.83 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  23.83 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  24.4 
 
 
436 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  25.95 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  25.32 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  29.5 
 
 
436 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  24.88 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  27.07 
 
 
429 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  27.97 
 
 
527 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  23.68 
 
 
405 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  22.73 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>