69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1362 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  889    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  70.64 
 
 
436 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  60.37 
 
 
435 aa  535  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  38.23 
 
 
446 aa  309  8e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  39.49 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  40.23 
 
 
440 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  41.87 
 
 
436 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  39.73 
 
 
464 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  39.21 
 
 
465 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  36 
 
 
486 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  34.95 
 
 
434 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  34.42 
 
 
434 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  46.67 
 
 
531 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  40.64 
 
 
456 aa  141  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  36.21 
 
 
520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  38.94 
 
 
539 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  43.56 
 
 
465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  40.62 
 
 
331 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  40.62 
 
 
331 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  44.53 
 
 
368 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  41.67 
 
 
356 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  39.06 
 
 
527 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  40.12 
 
 
337 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  39.52 
 
 
337 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  35.08 
 
 
376 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  33.49 
 
 
338 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  35.48 
 
 
627 aa  97.8  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  42.55 
 
 
292 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  39.29 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  29.73 
 
 
352 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  30.85 
 
 
331 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  30.77 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  91.3  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  38.02 
 
 
352 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  31.07 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  29.96 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  29.03 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  31.79 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  27.98 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  31.29 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  30.67 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  31.18 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  32.75 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  31.09 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  31.09 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  37.04 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  34.03 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  30.05 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  33.52 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  30.6 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  30.49 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  34.66 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  28.96 
 
 
502 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  28.77 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  32.57 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  27.16 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  29.1 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  29.09 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  36 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  29 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  31.25 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  27.44 
 
 
323 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  33.15 
 
 
344 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  31.47 
 
 
486 aa  57  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  31.62 
 
 
430 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  30.41 
 
 
330 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  29.58 
 
 
312 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  28.05 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>