79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1275 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  753    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  49.68 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  50.34 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  41.95 
 
 		 337 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  42.39 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  41.11 
 
 		 376 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  41.95 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  42.39 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  33.16 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  33.66 
 
 		 627 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  36.07 
 
 		 465 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  39.39 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  32.37 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  33.69 
 
 		 531 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  31.72 
 
 		 440 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  32.72 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  32.37 
 
 		 520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  29.33 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  37.3 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  35.54 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  30.34 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  37.3 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  37.61 
 
 		 292 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  36.32 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  30.79 
 
 		 539 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  36.41 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  35.84 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  31.51 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  37.63 
 
 		 335 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  36.26 
 
 		 465 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  37.63 
 
 		 335 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  37.63 
 
 		 335 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  31.54 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  36.62 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  33.46 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  37.5 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  37.02 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  35.16 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  28.78 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  36.67 
 
 		 527 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  37.98 
 
 		 449 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  31 
 
 		 335 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  31.37 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  31 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  36.96 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  32.84 
 
 		 334 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  39.18 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  31.08 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  31.16 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  31.79 
 
 		 442 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  29.74 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  36 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  29.65 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  32.71 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  29.65 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  35.59 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  33.82 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  30.65 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  34.09 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  29.77 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  36.79 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  32.61 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  31.3 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  25.85 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  29.49 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  29.47 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  29.18 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  31.27 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  33.95 
 
 		 430 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0724  hypothetical protein  36.6 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00775573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  31.58 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  26.55 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  27.05 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  26.44 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  26.44 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  26.67 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  25.75 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  35.85 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3127  hypothetical protein  33.03 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>