80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2955 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  697    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  43.79 
 
 
429 aa  248  8e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  39.53 
 
 
427 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  42.35 
 
 
424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  38.46 
 
 
438 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  38.46 
 
 
438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  41.42 
 
 
430 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  40.83 
 
 
430 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  36.23 
 
 
449 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  34.1 
 
 
430 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  37.24 
 
 
442 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  37.99 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  32.95 
 
 
502 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  38.91 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3127  hypothetical protein  32.21 
 
 
476 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  35.52 
 
 
465 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  29.49 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  32.89 
 
 
345 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  28.83 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  30.14 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  23.62 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  26.43 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  31.9 
 
 
520 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  28.3 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  32.07 
 
 
531 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  32.23 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  27.89 
 
 
627 aa  79.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  34.22 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  29.23 
 
 
436 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  25.21 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  25.82 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  31.96 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  29.95 
 
 
464 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  32.2 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  27.05 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  33.84 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  26.12 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  27.05 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  34.53 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  25.36 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  23.08 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  31.28 
 
 
436 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  29.89 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  29.89 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  27.59 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  29.52 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  27.36 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  29 
 
 
442 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  26.87 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  27.59 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  25.26 
 
 
546 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  32.67 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  25.81 
 
 
539 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  26.25 
 
 
312 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  32.61 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  26.7 
 
 
309 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  28.99 
 
 
527 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  25.94 
 
 
486 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  27.89 
 
 
486 aa  59.7  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  25.45 
 
 
434 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  30.56 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  31.45 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  32.42 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  27.2 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  27.2 
 
 
308 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  27.2 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  29.44 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  25.33 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  29.28 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  25.38 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  27.68 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  27.49 
 
 
356 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  29.24 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  26.67 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1190  hypothetical protein  31.02 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  25.35 
 
 
429 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  29.93 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  23.2 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0618  hypothetical protein  24.06 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>