71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4796 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  948    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  50.56 
 
 
440 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  42.7 
 
 
465 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  40.99 
 
 
446 aa  340  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  37.84 
 
 
438 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  38.44 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  40.65 
 
 
436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  39.73 
 
 
442 aa  297  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  37.33 
 
 
436 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  37.3 
 
 
435 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  40.13 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  39.81 
 
 
434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  34.26 
 
 
520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  37.44 
 
 
539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  41.42 
 
 
531 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  39.57 
 
 
456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  43.6 
 
 
465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  44.51 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  36.32 
 
 
627 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  33.2 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  35.94 
 
 
527 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  39.31 
 
 
337 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  38.73 
 
 
337 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  31.17 
 
 
331 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  31.17 
 
 
331 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  42.24 
 
 
356 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  38.8 
 
 
368 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  29.44 
 
 
427 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  36.36 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  37.73 
 
 
352 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  31.79 
 
 
352 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  30.38 
 
 
336 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  36.71 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  28.48 
 
 
335 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  28.8 
 
 
335 aa  94  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  29.43 
 
 
341 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  31.17 
 
 
438 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  37.02 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  30.19 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  28.16 
 
 
335 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  32.47 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  36.36 
 
 
292 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  37.65 
 
 
436 aa  84  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  30.53 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  32.43 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  30 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  31.72 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  31.75 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  28.44 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  28.87 
 
 
348 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  31.75 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  27.53 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  28.8 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  31.8 
 
 
502 aa  73.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  27.91 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  33.54 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  29.95 
 
 
354 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  31.6 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  34.9 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  29.68 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  25.29 
 
 
450 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  31.44 
 
 
546 aa  64.3  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  35.6 
 
 
344 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  28.26 
 
 
430 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  31.78 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  21.61 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  26.98 
 
 
442 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  29.71 
 
 
330 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  24.56 
 
 
323 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0724  hypothetical protein  26.37 
 
 
322 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00775573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>