79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0149 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1047    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  36.68 
 
 		 456 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  34.35 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  35.37 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  29.11 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  37.55 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  35.92 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  45.34 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  33.58 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  46.67 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  47.27 
 
 		 436 aa  144  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  44.04 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  34.63 
 
 		 331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  34.63 
 
 		 331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  38.16 
 
 		 465 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  33.6 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  34.12 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  36.09 
 
 		 376 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  31.53 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  41.42 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  32.92 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  32.92 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  33.57 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  38.61 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  38.61 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  30.16 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  33.69 
 
 		 387 aa  113  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  38.46 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  28.23 
 
 		 395 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  31.56 
 
 		 371 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  30.77 
 
 		 627 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  34.77 
 
 		 427 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  31.03 
 
 		 336 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  32.23 
 
 		 335 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  35.24 
 
 		 292 aa  98.2  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  35.79 
 
 		 438 aa  96.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  31.09 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  32.12 
 
 		 335 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  30.82 
 
 		 429 aa  95.1  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  31.09 
 
 		 352 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  32.12 
 
 		 335 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  32.12 
 
 		 332 aa  93.6  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  29.39 
 
 		 334 aa  92.8  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  39.77 
 
 		 449 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  29.07 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  35.33 
 
 		 352 aa  89  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  29.93 
 
 		 430 aa  86.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  36.76 
 
 		 438 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  35.44 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  35.52 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  32.07 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  37.06 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  29.32 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  29.19 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  35.07 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  34.22 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  33.51 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  36.09 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  27.09 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  40.3 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  31.33 
 
 		 486 aa  70.1  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  30.24 
 
 		 330 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  28.44 
 
 		 405 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  33.85 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  30.81 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  35.52 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  35.77 
 
 		 442 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  30.28 
 
 		 312 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0724  hypothetical protein  33.86 
 
 		 322 aa  51.6  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00775573  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  27.97 
 
 		 431 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  27.51 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  26.8 
 
 		 315 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  23.92 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1424  hypothetical protein  36.18 
 
 		 324 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.924519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1964  hypothetical protein  30.07 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.386343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>