77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05070 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  100 
 
 
436 aa  819    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  38.3 
 
 
336 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  36.82 
 
 
331 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  36.82 
 
 
331 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  43.01 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  40.3 
 
 
341 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  42.79 
 
 
344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  35.71 
 
 
337 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  35.71 
 
 
337 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  38.24 
 
 
627 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  43.09 
 
 
338 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  35.91 
 
 
371 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  45.12 
 
 
356 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  38.22 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  37.44 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  36.62 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  32.65 
 
 
345 aa  97.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  42.59 
 
 
456 aa  96.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  35.85 
 
 
520 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  39.41 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  39.18 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  40.85 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  34.43 
 
 
292 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  37.65 
 
 
464 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  40.85 
 
 
539 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  34.05 
 
 
438 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  35.44 
 
 
531 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  35.83 
 
 
486 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  38.55 
 
 
430 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  33.04 
 
 
449 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  33.85 
 
 
436 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  38.6 
 
 
502 aa  86.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  35.32 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  29.52 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  32.82 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  30.1 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  24.66 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  32.62 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  31.75 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  32.99 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  32.87 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  38.27 
 
 
527 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  36.14 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  41.53 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  25.13 
 
 
332 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  41.21 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  25.38 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  41.21 
 
 
335 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  36.04 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  36.02 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  35.8 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  35.8 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  24.74 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  26.79 
 
 
334 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  36.53 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  35.59 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  34.53 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  34.42 
 
 
438 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  30.77 
 
 
450 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  33.49 
 
 
351 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  35.03 
 
 
326 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  30.65 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  35.77 
 
 
430 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  33.71 
 
 
486 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  30.57 
 
 
323 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  31.11 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  34.12 
 
 
322 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  29.38 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  29.38 
 
 
307 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  29.38 
 
 
307 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  30.43 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  31.85 
 
 
431 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  34.15 
 
 
430 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  35.2 
 
 
546 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  27.78 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  30.93 
 
 
309 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1190  hypothetical protein  37.08 
 
 
324 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>