71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05430 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  100 
 
 
486 aa  977    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  38.44 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  39.78 
 
 
440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  41.33 
 
 
446 aa  280  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  36.32 
 
 
436 aa  266  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  36.11 
 
 
438 aa  263  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  36.56 
 
 
465 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  36 
 
 
442 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  42.99 
 
 
436 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  43.89 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  39.69 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  39.38 
 
 
434 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  37.55 
 
 
531 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  43.18 
 
 
456 aa  141  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  41.2 
 
 
520 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  43.1 
 
 
465 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  40.96 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  40.96 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  32.46 
 
 
539 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  39.2 
 
 
527 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  34.14 
 
 
337 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  34.14 
 
 
337 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  31.87 
 
 
338 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  30.99 
 
 
331 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  33.74 
 
 
356 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  29.55 
 
 
395 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  31.15 
 
 
368 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  28.67 
 
 
336 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  30.35 
 
 
627 aa  98.2  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  30.1 
 
 
376 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  35.84 
 
 
387 aa  97.1  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  33.2 
 
 
335 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  33.2 
 
 
335 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  36.2 
 
 
352 aa  93.6  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  30.97 
 
 
371 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  43.11 
 
 
352 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  37.16 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  31.41 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  27.98 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  30.37 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  29.46 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  34.55 
 
 
341 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  38.73 
 
 
292 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  29.02 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  27.06 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  27.41 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  32.62 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  34.73 
 
 
326 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  27.84 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  27.84 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  34.18 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  26.84 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  36.09 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  27.27 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  31.54 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  32.98 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  30.28 
 
 
502 aa  70.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  29.32 
 
 
424 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  32.88 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  30.87 
 
 
430 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  27.08 
 
 
354 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  24.76 
 
 
429 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  28.95 
 
 
450 aa  58.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  31.25 
 
 
430 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0724  hypothetical protein  32.65 
 
 
322 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00775573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  34.1 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  29.09 
 
 
486 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  25.84 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  30.04 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  29.03 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>