79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1158 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  99.4 
 
 
335 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  99.1 
 
 
335 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  40.57 
 
 
546 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  39.13 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  36.86 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  34.06 
 
 
465 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  32.77 
 
 
331 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  28.21 
 
 
331 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  28.21 
 
 
331 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  36.62 
 
 
456 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  34.6 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  34.6 
 
 
337 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  33.66 
 
 
376 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  36.82 
 
 
627 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  29.85 
 
 
341 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  33.33 
 
 
520 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  32.21 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  34.16 
 
 
395 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  33.1 
 
 
446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  36.79 
 
 
352 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  31.93 
 
 
531 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  42.62 
 
 
368 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  39.9 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  33.08 
 
 
539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  29.45 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  30.14 
 
 
438 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  37.62 
 
 
371 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  34.54 
 
 
400 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  32.56 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  34.73 
 
 
292 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  38.38 
 
 
345 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  29.52 
 
 
332 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  33.99 
 
 
486 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  30.4 
 
 
438 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  29.34 
 
 
465 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  29.52 
 
 
335 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  32.18 
 
 
440 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  37.63 
 
 
387 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  26.79 
 
 
429 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  28.19 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  28.51 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  33.82 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  33.99 
 
 
449 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  30.5 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  33.17 
 
 
436 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  35.92 
 
 
435 aa  92.8  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  29.95 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  31.09 
 
 
442 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  34.15 
 
 
527 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  41.53 
 
 
436 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  28.11 
 
 
405 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  28.02 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  35.9 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  39.47 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  41.07 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  28.5 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  30.85 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  31.56 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  31.43 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  39.87 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  36.42 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  27.94 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  35.17 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  28.99 
 
 
430 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  26.05 
 
 
430 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  30.26 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  30.26 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  30.26 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  30.53 
 
 
431 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  28.66 
 
 
323 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  33.79 
 
 
408 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  31.03 
 
 
309 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  28.08 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0724  hypothetical protein  28.73 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00775573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  25.79 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  30.11 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3127  hypothetical protein  26.87 
 
 
476 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>