77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1399 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  878    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  60.37 
 
 
442 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  59.08 
 
 
436 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  40.6 
 
 
438 aa  309  5e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  41.2 
 
 
440 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  37.39 
 
 
446 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  36.18 
 
 
465 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4404  hypothetical protein  40.69 
 
 
436 aa  285  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.938906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4796  hypothetical protein  37.3 
 
 
464 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0322  hypothetical protein  44.77 
 
 
434 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05430  putative integral membrane protein  43.89 
 
 
486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0324  hypothetical protein  44.12 
 
 
434 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.559062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  45.34 
 
 
531 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  40.7 
 
 
456 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  44 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3064  hypothetical protein  46.63 
 
 
465 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000992265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  41.57 
 
 
331 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  41.57 
 
 
331 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  41.92 
 
 
520 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  37.56 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  36.14 
 
 
627 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  30.86 
 
 
337 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  45.99 
 
 
368 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  30.48 
 
 
337 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  30.28 
 
 
338 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  37.43 
 
 
331 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  33.15 
 
 
395 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  96.3  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  31.88 
 
 
352 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  39.2 
 
 
527 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  27.92 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  42.34 
 
 
292 aa  92.8  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  32.63 
 
 
334 aa  92.8  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  33.54 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  32.93 
 
 
332 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  33.54 
 
 
335 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  35.16 
 
 
387 aa  89  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  33.93 
 
 
348 aa  87.4  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  38.07 
 
 
352 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  26.46 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  38.51 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  27.89 
 
 
546 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  26.92 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  38.89 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  35.92 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  32.24 
 
 
449 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  35.92 
 
 
335 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  29.65 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  30.51 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  29.47 
 
 
502 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  32.07 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  31.75 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  31.55 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  39.07 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  28.57 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  30.86 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  32.2 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  28.7 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1811  membrane protein-like  28.8 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  27.65 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  24.62 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31739  predicted protein  28.21 
 
 
486 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.659517  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  33.13 
 
 
344 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  32.39 
 
 
450 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  28.12 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  26.95 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  31.93 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  25.78 
 
 
430 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  26.09 
 
 
315 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  26.58 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  27.95 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0724  hypothetical protein  34.85 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00775573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  25.77 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  25.77 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  25.77 
 
 
308 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  25.2 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>