91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4419 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4419  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1673  hypothetical protein  59.36 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3753  hypothetical protein  53.88 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000391116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0840  hypothetical protein  57.53 
 
 		 219 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4298  hypothetical protein  56.62 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3382  hypothetical protein  52.51 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704087  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3332  hypothetical protein  51.85 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3105  hypothetical protein  49.77 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000234851  normal  0.527645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0772  hypothetical protein  47.69 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal  0.28705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4143  hypothetical protein  48.15 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.409025  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5729  hypothetical protein  47.03 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86097  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0154  hypothetical protein  46.46 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0660485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25100  hypothetical protein  45.05 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1961  hypothetical protein  37.27 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0400694 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  27.65 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03421  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00670)  27.39 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620019  normal  0.0597509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  29.58 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  32.85 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  32.98 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05841  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  30.64 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  32.05 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.91 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  34.42 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.19 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  31.65 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08634  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  27.22 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  31.65 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.94 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  33.77 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  28.64 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  29.8 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.52 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.77 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  30.52 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  30.52 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  28.48 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  31.85 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  29.03 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  28.48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  28.48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  28.48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  28.48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  28.48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  28.48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41353  predicted protein  29.41 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  26.05 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.53 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57883  predicted protein  26.05 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0900155  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 329 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  28.63 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  24.46 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  27.19 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.74 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  30.52 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  27.56 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  23.61 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1438  hypothetical protein  76 
 
 		 55 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  24.15 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  23.81 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0358  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  25.33 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  25.64 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2944  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.4 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  28.78 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  29.5 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02123  hypothetical protein  27.32 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  28.78 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46234  predicted protein  22.58 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  25.33 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  27.92 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3620  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 		 214 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  27.86 
 
 		 214 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  33.77 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  25.9 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00783  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.15 
 
 		 165 aa  41.6  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.842186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>