68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3382 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  59.26 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  47.16 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.16 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  32.98 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  37.97 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  33.51 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1144  DMSO-membrane protein  32.97 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  27.6 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  25.77 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  23.35 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.37 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.91 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  25.4 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  25.91 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  25.91 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  25.91 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  25.91 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  25.4 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  25.91 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  26.8 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  26.7 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  26.7 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  26.18 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  26.18 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  26.18 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  25.74 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  26.24 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  25.74 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  24.21 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  24.74 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  24.21 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.86 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  24.75 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  21.5 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  23.23 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.01 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  23.3 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.7 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  28.15 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.72 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  23 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  27.86 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.6 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  26.77 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.91 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.89 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.11 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.98 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0512  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  32.43 
 
 		 313 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.29 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.6 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.06 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.13 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.48 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.83 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.95 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  27.44 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.35 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.35 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02390  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.18 
 
 		 218 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.8 
 
 		 236 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  29.41 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  27.27 
 
 		 223 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.82 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>