277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3313 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  82.47 
 
 		 155 aa  265  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  81.29 
 
 		 155 aa  263  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  80.65 
 
 		 155 aa  257  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  80 
 
 		 155 aa  257  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  80 
 
 		 155 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  75.32 
 
 		 155 aa  237  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  65.58 
 
 		 154 aa  192  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  60.65 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 162 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 152 aa  174  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  59.74 
 
 		 157 aa  173  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  55.48 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  59.21 
 
 		 155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  57.32 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  57.24 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  55.41 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  54.25 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  53.95 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  50.32 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  50.32 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  53.21 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  50.97 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  53.59 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  60.39 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  50.64 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  55.03 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  53.29 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  56.13 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  53.95 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  49.01 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  52.63 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  51.32 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  46.31 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  56.58 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  53.02 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  51.01 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  45.64 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  50.33 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  54.36 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  44.52 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  43.06 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  45.64 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  46.84 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  45.27 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  49.02 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  47.22 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1258  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  45.03 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  46.58 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  45.03 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 165 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  44.74 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  44.74 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  44.74 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  45.81 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  43.23 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  43.33 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  40.56 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  48.18 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>