More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3117 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  74.77 
 
 		 114 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  73.79 
 
 		 117 aa  166  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  75.93 
 
 		 136 aa  166  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  76.15 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  73.15 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  83.33 
 
 		 87 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  64.89 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  60 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  58.7 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  57.61 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  60.87 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  62.77 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  59.04 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  52.53 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  55.29 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  51.04 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  56.63 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  56.63 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  54.12 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  54.12 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  55.42 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  56.79 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  49.41 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  52.44 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  54.69 
 
 		 78 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  55 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  48.53 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  48.53 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  50.68 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  57.38 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  54.1 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  57.38 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  52.38 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  46.05 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  59.02 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50.79 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  52.38 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  48.53 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  52.38 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.46 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  54.1 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  48.53 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.46 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.46 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.46 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  52.05 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.06 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  54.69 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  52.38 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  51.61 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  43.66 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  49.18 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  46.03 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  43.06 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  52.46 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  47.56 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  53.97 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  47.56 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  47.06 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  54.1 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.76 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  53.97 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  50.79 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  47.56 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  46.55 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.55 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  46.97 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  54.1 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  46.97 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04611  hypothetical protein  54.1 
 
 		 63 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  45.21 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  49.18 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  47.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.46 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  37.93 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  46.67 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0406  hypothetical protein  54.1 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  49.18 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  50.79 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  46.27 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  49.21 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  40.48 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3122  protein of unknown function DUF37  39.47 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566659  hitchhiker  0.0000000540295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2145  hypothetical protein  46.77 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165245  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  49.18 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  47.54 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  45.21 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  52.46 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2394  hypothetical protein  47.37 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  51.72 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  47.76 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04721  hypothetical protein  52.46 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.132179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  44.29 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>