More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2583 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  80.48 
 
 		 455 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  78.56 
 
 		 442 aa  665    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  82.49 
 
 		 457 aa  728    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 461 aa  923    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  83.14 
 
 		 434 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  81.67 
 
 		 444 aa  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  80.09 
 
 		 459 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  65.84 
 
 		 457 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  61.18 
 
 		 474 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  61.37 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  58.86 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  61.19 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  60.91 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  60.91 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  60.78 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  59.86 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  60.18 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.67 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  56.49 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  56.78 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  58.87 
 
 		 465 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  56.62 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  54.87 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  56.42 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  56.65 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  58.37 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  57.42 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  54 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  55.38 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  49.44 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  54.48 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.75 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  55.58 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  52.38 
 
 		 423 aa  385  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  55.18 
 
 		 432 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  51.57 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  55.01 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  52.9 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  52.26 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  52.2 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  51.84 
 
 		 448 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  52.3 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  50.78 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.95 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.74 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.27 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  48.1 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  47.95 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  46.11 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  52.35 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  52.35 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.68 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  44.33 
 
 		 435 aa  286  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  46.03 
 
 		 489 aa  286  8e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  49.18 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  49.18 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  46.03 
 
 		 489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  43.52 
 
 		 435 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  46.34 
 
 		 439 aa  282  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  43.21 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  46.95 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  46.95 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.22 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  46.95 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  43.53 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  44.84 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  46.54 
 
 		 441 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.05 
 
 		 428 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.79 
 
 		 414 aa  279  9e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  45.26 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  44.65 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.54 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  42.32 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  47.67 
 
 		 433 aa  277  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  50.63 
 
 		 384 aa  276  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  43.77 
 
 		 432 aa  276  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.85 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.31 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.08 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  50.96 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  45.8 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.27 
 
 		 394 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  45.8 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  43.52 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  47.77 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.96 
 
 		 421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  44.47 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.43 
 
 		 429 aa  273  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  43.98 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  43.98 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  43.73 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.98 
 
 		 415 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  43.73 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  51.29 
 
 		 404 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  51.29 
 
 		 404 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  43.73 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  45.08 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.6 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  43.24 
 
 		 436 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  43.73 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>