More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1049 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 495 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  53.59 
 
 		 487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 506 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 		 494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 		 494 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  32.57 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  31.03 
 
 		 487 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 559 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  30.82 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 487 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 487 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 509 aa  223  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 498 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 468 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.61 
 
 		 518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 513 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 		 528 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.42 
 
 		 509 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 		 508 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  25.31 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  26.81 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  28.03 
 
 		 575 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  26.81 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 630 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 555 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 525 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  26.62 
 
 		 575 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  28.38 
 
 		 575 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 502 aa  153  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  28.38 
 
 		 575 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 596 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  27.24 
 
 		 576 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 520 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 662 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  26.64 
 
 		 575 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  27.5 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  27.72 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  27.98 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.54 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  26.27 
 
 		 557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  28.51 
 
 		 504 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  26.38 
 
 		 570 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  27.79 
 
 		 570 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  27.79 
 
 		 576 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  27.79 
 
 		 576 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  27.79 
 
 		 576 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 		 499 aa  146  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  27.79 
 
 		 576 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 551 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.91 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 		 525 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 522 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  29.78 
 
 		 578 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.24 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  25.57 
 
 		 576 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  26.9 
 
 		 562 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  25.47 
 
 		 557 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.24 
 
 		 510 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.05 
 
 		 510 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  28.93 
 
 		 535 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.85 
 
 		 510 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  28.07 
 
 		 555 aa  143  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 		 517 aa  143  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  25.23 
 
 		 552 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.85 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.1 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.85 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  25.84 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 571 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  26.44 
 
 		 577 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  26.44 
 
 		 577 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.8 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.85 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  26.47 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  25.52 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>