69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0256 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  85.09 
 
 		 369 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  85.09 
 
 		 369 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  83.47 
 
 		 369 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  75.41 
 
 		 367 aa  564  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  42.43 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  41.99 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  39.76 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  39.76 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  39.76 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.43 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.64 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  29.61 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.46 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  38.01 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  32.33 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  33.03 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  38.91 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  32.04 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  33.96 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  33.59 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  38.34 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.38 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.77 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  33.2 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.79 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  31.84 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  31.84 
 
 		 351 aa  96.3  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  28.97 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.52 
 
 		 521 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  28.07 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  32.16 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  27.73 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  25.93 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  29.81 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  28.93 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  28.93 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  27.37 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  26.98 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  24.65 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.02 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  26.51 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  30.61 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.48 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.49 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  26.91 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  28.69 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  28.09 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  28.12 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  28.12 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  26.88 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.4 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.88 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.78 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  23.91 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  21.26 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  25.87 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  27.14 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  21.65 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  25.87 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  25.4 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  26.09 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  26.09 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.37 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  28.33 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  25.39 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  25.91 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  23.08 
 
 		 381 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  24.54 
 
 		 270 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>