More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4172 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.72 
 
 		 462 aa  853    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  83.3 
 
 		 466 aa  765    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 462 aa  935    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  87.23 
 
 		 462 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.24 
 
 		 462 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  83.98 
 
 		 477 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  80.3 
 
 		 462 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.65 
 
 		 460 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  66.89 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  64.13 
 
 		 468 aa  588  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  64.13 
 
 		 468 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.85 
 
 		 474 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.82 
 
 		 472 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.32 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.06 
 
 		 453 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.78 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.6 
 
 		 472 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.11 
 
 		 469 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.68 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  57.99 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  60.79 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.09 
 
 		 447 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  57.05 
 
 		 440 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  56.38 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  60.24 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 		 468 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  40.27 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  39.01 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 717 aa  199  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  41.11 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 494 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.98 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 469 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  39.71 
 
 		 276 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  35.19 
 
 		 425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 441 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  39.13 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 483 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  29.56 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  28.87 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 472 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  36.82 
 
 		 435 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  36.67 
 
 		 344 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 456 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  27.92 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  36.69 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  37.76 
 
 		 270 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  36.69 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  36.27 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  36.46 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  39.36 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  36.29 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  39.36 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  39.36 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  39.36 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  39.36 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  36.64 
 
 		 461 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.88 
 
 		 442 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>