32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2532 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2532  helicase-like  100 
 
 		 1424 aa  2898    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2887  helicase-like  38.31 
 
 		 1401 aa  814    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4912  helicase domain-containing protein  38.08 
 
 		 1410 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.939232  normal  0.678438 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0220  helicase domain-containing protein  38.31 
 
 		 1401 aa  814    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3760  helicase domain-containing protein  26.18 
 
 		 1201 aa  276  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1186  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 1189 aa  251  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5350  helicase domain protein  27.22 
 
 		 1323 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.211089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1328  helicase-like  26.16 
 
 		 1159 aa  194  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0226  helicase-like  26.86 
 
 		 1131 aa  194  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0240002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  26.46 
 
 		 1285 aa  189  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2728  helicase domain protein  26.35 
 
 		 1314 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3675  helicase, C-terminal  26.61 
 
 		 1332 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4780  helicase domain-containing protein  25.62 
 
 		 1235 aa  185  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  normal  0.0133123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2203  helicase domain-containing protein  26.98 
 
 		 1339 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0658307  normal  0.544533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2322  helicase domain protein  25.69 
 
 		 1252 aa  183  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1514  helicase-like  23.93 
 
 		 1082 aa  181  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0466  helicase domain protein  27.25 
 
 		 1226 aa  177  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0813  helicase-like protein  27.36 
 
 		 1220 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0350  helicase domain protein  28.1 
 
 		 1062 aa  177  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0829  helicase domain-containing protein  27.36 
 
 		 1220 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03280  helicase family protein  26.69 
 
 		 1254 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.870553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2521  helicase domain protein  26.76 
 
 		 1287 aa  171  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0400508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1184  helicase domain-containing protein  25.27 
 
 		 1321 aa  163  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2033  helicase domain protein  24.61 
 
 		 1101 aa  156  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1273  helicase domain-containing protein  25.91 
 
 		 1188 aa  154  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4101  helicase-like  26.09 
 
 		 1071 aa  154  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2653  helicase domain protein  27.99 
 
 		 1173 aa  145  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1966  helicase domain-containing protein  26.46 
 
 		 1162 aa  141  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2676  helicase-like  29.68 
 
 		 1374 aa  135  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.89575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1056  helicase domain protein  27.85 
 
 		 1063 aa  133  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1415  helicase domain protein  24.53 
 
 		 1215 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.85 
 
 		 897 aa  46.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>