113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0565 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328589  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0263  hypothetical protein  79.57 
 
 		 328 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.744108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1136  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.87 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0604379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  27.65 
 
 		 861 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  27.27 
 
 		 875 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  27.09 
 
 		 861 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  27.09 
 
 		 861 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  28.2 
 
 		 855 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  27.18 
 
 		 856 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  29 
 
 		 896 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  27.33 
 
 		 856 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  27.1 
 
 		 890 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  30.34 
 
 		 881 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  26.83 
 
 		 874 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  27.27 
 
 		 856 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  26.07 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  27.39 
 
 		 855 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  27.39 
 
 		 855 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  24.23 
 
 		 874 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  26.67 
 
 		 885 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  29.35 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  29.37 
 
 		 584 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  27.45 
 
 		 895 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  25.81 
 
 		 872 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  28.94 
 
 		 585 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  28.83 
 
 		 887 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  25.68 
 
 		 862 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  22.18 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.28 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  28.78 
 
 		 882 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  28.21 
 
 		 914 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  27.82 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  22.18 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  25.93 
 
 		 858 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  27.69 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  26.17 
 
 		 855 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  26.11 
 
 		 876 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0257  cyanophycin synthetase-like  23.65 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  26.6 
 
 		 755 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  25 
 
 		 865 aa  66.2  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  26.6 
 
 		 755 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  25.42 
 
 		 918 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3472  glutathione synthase  22.14 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.680273  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  25.87 
 
 		 910 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  24.44 
 
 		 856 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  24.51 
 
 		 893 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  25.98 
 
 		 879 aa  62.4  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  27.59 
 
 		 879 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  24.15 
 
 		 877 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  30.13 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  24.15 
 
 		 877 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  25.98 
 
 		 579 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  24.56 
 
 		 894 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  26.35 
 
 		 908 aa  59.7  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  24.22 
 
 		 901 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  25.29 
 
 		 902 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  26.24 
 
 		 612 aa  59.3  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  27.2 
 
 		 906 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  25.38 
 
 		 900 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  29.38 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  28.04 
 
 		 939 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  27.11 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  26.59 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3007  cyanophycin synthetase domain-containing protein  22.62 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.16 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.61 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  26.47 
 
 		 894 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7496  hypothetical protein  28.67 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  25.29 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  27.88 
 
 		 637 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5052  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes-like  26.04 
 
 		 790 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46089  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  25.82 
 
 		 562 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  26.97 
 
 		 581 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 		 582 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  26.97 
 
 		 581 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  26.97 
 
 		 581 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  27.3 
 
 		 582 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  24.79 
 
 		 646 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0566  hypothetical protein  24.9 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.937082  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  25.39 
 
 		 757 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  24.62 
 
 		 730 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0916  glutathione synthase  26.05 
 
 		 616 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  26.1 
 
 		 581 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  25.57 
 
 		 886 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  25.57 
 
 		 886 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  21.59 
 
 		 573 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  25.19 
 
 		 746 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0475  hypothetical protein  28.74 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0441686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.43 
 
 		 754 aa  50.4  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 		 609 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0274694  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  27.14 
 
 		 722 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  29.19 
 
 		 664 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  23.7 
 
 		 578 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  24.62 
 
 		 878 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  26.34 
 
 		 581 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>