30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0544 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  82.93 
 
 		 359 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  75.5 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  71.88 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  61.9 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  62.18 
 
 		 359 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  55.97 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  46.3 
 
 		 341 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  38.99 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  37.97 
 
 		 339 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  39.81 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  39.27 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  39.02 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  38.72 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  34.13 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  32.12 
 
 		 283 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  31.75 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  29.41 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  31.62 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  31.66 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  31.37 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  29.62 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  30.51 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  27.62 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  25.75 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.78 
 
 		 1016 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  26.43 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  27.76 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  26.8 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  23.64 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>