106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1323 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  100 
 
 		 163 aa  326  7e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  36.54 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  31.4 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  35.25 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  30.83 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  30.83 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  30.83 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  30.83 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  30.83 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  37.5 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  33.03 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  39.81 
 
 		 139 aa  72  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  39.81 
 
 		 139 aa  72  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  34.78 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  33.91 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  33.91 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  36.36 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  34.78 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  39.78 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  34.78 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  34.78 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  39.78 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  33.6 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  33.91 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  33.91 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  37.17 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  29.46 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  37.19 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  37.19 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  37.19 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  37.19 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  37.19 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  33.63 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  35.43 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  32.12 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  35.35 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  39.33 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  35.35 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  35.35 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  35.35 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  35.35 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  35.35 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  35.35 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  35.35 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  34.34 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  34.34 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  34.34 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  36.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  36.21 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  35.34 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  33.94 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  32.46 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  32.46 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  28.23 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  34.41 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  34.41 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  34.41 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  34.91 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  37.63 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  29.6 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  25.71 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.2  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  31.18 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  31.18 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  31.18 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  31.18 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  30.1 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  28.85 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  28.85 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  27.88 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  27.88 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  27.88 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  27.88 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  27.88 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  27.88 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  27.88 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  27.88 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  34.48 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  24.75 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  26 
 
 		 116 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  28.45 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  28.26 
 
 		 118 aa  47.4  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  33.33 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  20.93 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0273  hypothetical protein  38 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0184  hypothetical protein  30.85 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0268  hypothetical protein  37 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  23.42 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  20.17 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  20.17 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  26.61 
 
 		 248 aa  43.9  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  23.39 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  25.64 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  23.36 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  23.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  31.48 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  31.11 
 
 		 131 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  31.11 
 
 		 131 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  23.33 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  28.44 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>