33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3042 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  99.12 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  90.71 
 
 		 226 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  87.61 
 
 		 226 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  74.55 
 
 		 224 aa  347  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  67.28 
 
 		 217 aa  311  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  59.73 
 
 		 730 aa  274  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  63.38 
 
 		 217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  60.93 
 
 		 231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  54.93 
 
 		 216 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  57.28 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  59.15 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  54.34 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  60.1 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 227 aa  244  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  51.8 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  50.94 
 
 		 220 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.67 
 
 		 743 aa  226  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  50.45 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  48.6 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  43.12 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  41.12 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  38.5 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  27.62 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  25.65 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  30.38 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.67 
 
 		 647 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.37 
 
 		 650 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  25.66 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.05 
 
 		 623 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  20.62 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  22.99 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>