45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5193 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 		 467 aa  969    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  43.56 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  50.46 
 
 		 352 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  40.25 
 
 		 551 aa  299  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  37.3 
 
 		 552 aa  279  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  38.08 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  36.76 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  36.76 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  37.59 
 
 		 551 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  37.64 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  34.21 
 
 		 555 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  36.98 
 
 		 568 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  35.55 
 
 		 536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  36.48 
 
 		 559 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  35.13 
 
 		 550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  34.51 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  34.77 
 
 		 530 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  35.37 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  35.9 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  36.82 
 
 		 552 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  35.5 
 
 		 545 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  30.75 
 
 		 470 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  31.02 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  29.79 
 
 		 540 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  25.77 
 
 		 490 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  24.63 
 
 		 549 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  24.54 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  37.08 
 
 		 234 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  26.2 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  23.69 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  22.6 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  22.6 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  22.6 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  22.6 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  29.66 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  21.74 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  23.79 
 
 		 298 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  23.27 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  24.48 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  24.49 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  24.49 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  24.49 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  25.6 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  24.49 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  26.09 
 
 		 304 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>