21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3253 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  53.4 
 
 		 931 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  100 
 
 		 889 aa  1831    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  31.74 
 
 		 1054 aa  180  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  24.21 
 
 		 875 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  32.34 
 
 		 310 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  32.34 
 
 		 310 aa  129  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  30.08 
 
 		 964 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  26.53 
 
 		 989 aa  109  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01469  hypothetical protein  36.57 
 
 		 299 aa  109  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4026  EF hand domain-containing protein  40.26 
 
 		 196 aa  94  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1774  hypothetical protein  29.68 
 
 		 697 aa  90.5  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  33.96 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  21.26 
 
 		 674 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  29.27 
 
 		 743 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  34.95 
 
 		 740 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5413  EF hand domain protein  21.45 
 
 		 792 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  29.82 
 
 		 425 aa  49.7  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  31.43 
 
 		 827 aa  48.9  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  30.1 
 
 		 776 aa  48.5  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  27.59 
 
 		 751 aa  46.2  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  33 
 
 		 776 aa  45.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>