More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1424 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  93.39 
 
 
333 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  93.39 
 
 
333 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  93.39 
 
 
333 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  80.42 
 
 
334 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  76.2 
 
 
334 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  75 
 
 
334 aa  527  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  71.82 
 
 
386 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.42 
 
 
335 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.76 
 
 
335 aa  433  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.77 
 
 
344 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.24 
 
 
347 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.7 
 
 
347 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  62.28 
 
 
334 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  48.51 
 
 
344 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.9 
 
 
341 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 
339 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.37 
 
 
337 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  48.95 
 
 
340 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.95 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.66 
 
 
344 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  47.2 
 
 
343 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
342 aa  309  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.31 
 
 
340 aa  309  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  45.4 
 
 
345 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  47.48 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  49.11 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.29 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.65 
 
 
334 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  45.99 
 
 
345 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  45.99 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.99 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.29 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.4 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.4 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.4 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.4 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.8 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  45.4 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  45.7 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  45.7 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.11 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 
332 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.62 
 
 
338 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.4 
 
 
345 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.4 
 
 
345 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  46.87 
 
 
348 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.18 
 
 
337 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.99 
 
 
345 aa  299  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.11 
 
 
332 aa  298  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 
347 aa  297  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
346 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 
337 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.45 
 
 
334 aa  294  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.45 
 
 
336 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.15 
 
 
336 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.31 
 
 
341 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.15 
 
 
341 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.71 
 
 
332 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  46.15 
 
 
336 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  47.8 
 
 
347 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  45.72 
 
 
341 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.18 
 
 
345 aa  292  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.6 
 
 
341 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.38 
 
 
334 aa  292  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.88 
 
 
342 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
339 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.41 
 
 
345 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.36 
 
 
406 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  46.29 
 
 
338 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.91 
 
 
332 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.06 
 
 
469 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 
339 aa  288  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.06 
 
 
479 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.99 
 
 
338 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.06 
 
 
427 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  43.03 
 
 
331 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
339 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.06 
 
 
338 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 
338 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 
339 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.36 
 
 
341 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  48.19 
 
 
340 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
339 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.51 
 
 
344 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 
342 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 
347 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.77 
 
 
422 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
332 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.9 
 
 
344 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.77 
 
 
338 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.59 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
343 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.21 
 
 
338 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>