191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0774 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  87.5 
 
 
104 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  86.54 
 
 
104 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  85.58 
 
 
104 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  73.08 
 
 
104 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.79 
 
 
98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  38.71 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.8 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  36.99 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.63 
 
 
97 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  41.18 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  36.36 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  33.78 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  36.36 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  42.11 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  36.36 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  45.65 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.96 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.59 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  43.48 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  40.91 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  29.87 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  38.36 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.94 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  27.91 
 
 
96 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  29.07 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  27.96 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.14 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  29.41 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.44 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.59 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  32.97 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  27.63 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
106 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  30.3 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.68 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2276  hypothetical protein  37.1 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.26 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  31.43 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.26 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>