240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3567 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  96.84 
 
 		 253 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  96.44 
 
 		 276 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  95.26 
 
 		 253 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  58.57 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  51 
 
 		 253 aa  234  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  49.19 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  49.6 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  47.58 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  47.58 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  48.54 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  47.58 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  49.19 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  48.59 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  50.82 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  47.98 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  47.98 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  48.4 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  48.79 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  49.36 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  48.39 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  43.5 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  46.8 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  52.21 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  47.01 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  42.97 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  42.17 
 
 		 254 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  41.13 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  44.58 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  42.08 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  40.51 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  41.15 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  44.21 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  40.74 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  45.8 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  40.33 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  41.22 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  38.93 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  38.62 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  38.93 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  39.34 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  40.71 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  40.5 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  43.5 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  37.96 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  39.75 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  39.75 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  41.49 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  39.02 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  40.24 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  40.24 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  39.27 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  39.91 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  36.03 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  42.52 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.07 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  33.86 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  42.65 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  42.27 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  43.44 
 
 		 290 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  35.35 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  33.6 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  39.53 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0553  protein of unknown function DUF81  41.1 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  35.25 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  35.25 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  38.14 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  34.71 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  40.48 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  34.71 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  34.15 
 
 		 270 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  32.93 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 		 270 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  34.17 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  37.33 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  34.92 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  34.01 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  37.33 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  34.89 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  32.52 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  33.6 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  33.6 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  33.6 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  33.07 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  33.07 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  35.97 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>