30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2299 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  78.21 
 
 		 996 aa  1570    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  92.67 
 
 		 996 aa  1897    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 996 aa  2049    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  86.55 
 
 		 996 aa  1754    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  87.55 
 
 		 996 aa  1789    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  87.85 
 
 		 996 aa  1781    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  25 
 
 		 947 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  25 
 
 		 947 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  25.37 
 
 		 947 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  30.3 
 
 		 953 aa  52.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  30.3 
 
 		 870 aa  52.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1007 aa  52.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  24.88 
 
 		 852 aa  53.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  26.56 
 
 		 853 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  26.04 
 
 		 858 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  26.04 
 
 		 858 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1174 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  25.55 
 
 		 949 aa  49.3  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1160 aa  48.5  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  25.66 
 
 		 890 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  25.25 
 
 		 856 aa  48.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  25.65 
 
 		 893 aa  48.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  26.21 
 
 		 945 aa  47.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3851  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1104 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  29.35 
 
 		 862 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  27.45 
 
 		 907 aa  47  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  27.45 
 
 		 890 aa  47  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  26.02 
 
 		 875 aa  46.2  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  26.47 
 
 		 893 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1461 aa  45.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>