39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2349 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  798    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  65.3 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  66.12 
 
 		 399 aa  461  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  65.04 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  57.29 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  55.3 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0188  hypothetical protein  63.89 
 
 		 114 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  29.22 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  29.22 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  29.22 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  29.03 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  32.41 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  20.65 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  26.85 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>