93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2312 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2312  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.92281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2316  hypothetical protein  33.7 
 
 		 189 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.401448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2037  hypothetical protein  35.98 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1266  hypothetical protein  34.39 
 
 		 184 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000976749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1878  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins-like  31.35 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.137152  hitchhiker  0.0012387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3017  hypothetical protein  32.6 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.22 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1797  ComEA-related protein  35.26 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00425429  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.26 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1157  comE operon protein 1, putative  28.95 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2555  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  40.79 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.47 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.87 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  29.29 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1611  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  49.18 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  30.99 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4318  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  48.08 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2285  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.84 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1257  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  46.27 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0994426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12930  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.7 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149409  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.34 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0279  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  32.14 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0666244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.89 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2552  helix-hairpin-helix motif protein  45.76 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.07 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2129  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  43.86 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0407  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  45.61 
 
 		 131 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000244274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2273  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  27.52 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1596  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  28.19 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.86 
 
 		 290 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2102  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.61 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1000  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25.82 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.47 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.55 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1625  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  39.66 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  34.78 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1691  hypothetical protein  37.14 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.631866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.51 
 
 		 181 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  37.5 
 
 		 279 aa  48.5  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3435  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.67 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218719  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12443  hypothetical protein  50.94 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3469  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.67 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2830  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.71 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.919156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2010  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.54 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3093  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.26 
 
 		 107 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2104  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  25 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3848  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.67 
 
 		 279 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0329  DNA uptake protein  37.5 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0496  DNA uptake-like protein  37.5 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1287  DNA uptake protein and related DNA-binding protein  64.71 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1142  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat-containing protein  36.67 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.935531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2082  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  42.37 
 
 		 169 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.918222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2211  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  50 
 
 		 320 aa  45.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.37 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0963672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1202  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.99 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  45.1 
 
 		 277 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1635  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.68 
 
 		 100 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07770  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  22.67 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.734048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2451  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  22.52 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  23.68 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.29 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.29 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  23.68 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1371  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.2 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.106301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  25.17 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17330  DNA uptake protein  26.06 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.353261  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0826  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  40.35 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0217462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2181  ComEA-related protein  31.15 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1689  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  44.07 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3525  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.1 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3915  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.98 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3593  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.1 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  38.1 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1518  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.46 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.663544  normal  0.893381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1589  DNA uptake protein related DNA-binding protein  25.17 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.821877  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0781  competence protein CelA  21.26 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.918663  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20070  ComEA-related protein  48.98 
 
 		 110 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1429  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.24 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0894635  hitchhiker  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.84 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.82 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1562  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  36.67 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2014  DNA uptake protein  39.68 
 
 		 148 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40 
 
 		 114 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.06 
 
 		 93 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3498  hypothetical protein  34.52 
 
 		 101 aa  42  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1521  late competence protein required for DNA binding and uptake  24.2 
 
 		 231 aa  42  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1886  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.4 
 
 		 300 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.528332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  35.29 
 
 		 99 aa  41.6  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  35.29 
 
 		 99 aa  41.6  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0835  hypothetical protein  37.5 
 
 		 299 aa  41.6  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>