91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2316 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2316  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.401448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1266  hypothetical protein  39.89 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000976749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3017  hypothetical protein  39.25 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1797  ComEA-related protein  39.66 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00425429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1878  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins-like  35.59 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.137152  hitchhiker  0.0012387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1008  hypothetical protein  36.67 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2312  hypothetical protein  33.7 
 
 		 222 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.92281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2037  hypothetical protein  34.04 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.18 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  29.05 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1562  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  28.17 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  31.17 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.88 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  29.25 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.11 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0313  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  29.25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0283813  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.46 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2830  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.57 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.919156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  25.48 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1157  comE operon protein 1, putative  22.49 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3189  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.18 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1257  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  26.06 
 
 		 422 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0994426 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.74 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1202  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.59 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  25.85 
 
 		 279 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.12 
 
 		 271 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1611  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  48.28 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3435  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.47 
 
 		 304 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218719  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1596  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  28.66 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1521  late competence protein required for DNA binding and uptake  29.03 
 
 		 231 aa  51.2  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.49 
 
 		 277 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1635  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.54 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.5 
 
 		 296 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0773  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.38 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.466163  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  26.7 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.1 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12590  DNA uptake protein  27.71 
 
 		 352 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2014  DNA uptake protein  34.72 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2273  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  32.47 
 
 		 259 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1142  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat-containing protein  44.44 
 
 		 315 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.935531 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.1 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1813  DNA uptake protein  35.29 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1113  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.4 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.560753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2451  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.43 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2117  DNA uptake protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0826  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  32.35 
 
 		 355 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0217462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3888  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  50 
 
 		 105 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0912284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2211  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  29.87 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2047  DNA uptake protein  34.78 
 
 		 135 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0755007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2176  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  27.44 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2967  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  45.31 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1429  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0894635  hitchhiker  0.000989669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0767  competence protein ComE, putative  44.07 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  45.28 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  40.98 
 
 		 107 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1518  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.11 
 
 		 377 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.663544  normal  0.893381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2102  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.79 
 
 		 319 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  26.11 
 
 		 301 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  46 
 
 		 90 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3848  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.65 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  46.34 
 
 		 114 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2104  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  21.24 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0407  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30 
 
 		 131 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000244274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1287  DNA uptake protein and related DNA-binding protein  43.33 
 
 		 306 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7078  putative DNA-binding protein  26.42 
 
 		 385 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3469  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.65 
 
 		 280 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.41 
 
 		 290 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0781  competence protein CelA  27.33 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.918663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1000  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  24.14 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12443  hypothetical protein  49.02 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12930  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25.73 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149409  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  34.21 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  21.89 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3053  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  19.11 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  48 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  21.89 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.28 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2552  helix-hairpin-helix motif protein  52.27 
 
 		 298 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  38.33 
 
 		 267 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.51 
 
 		 263 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0963672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3525  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.33 
 
 		 267 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3593  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.33 
 
 		 267 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17330  DNA uptake protein  41.38 
 
 		 305 aa  42  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.353261  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  46 
 
 		 111 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1257  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25.15 
 
 		 219 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0496  DNA uptake-like protein  43.64 
 
 		 220 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.9 
 
 		 135 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.9 
 
 		 135 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3915  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42 
 
 		 269 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0993  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.68 
 
 		 90 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0367342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1886  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  29.14 
 
 		 300 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.528332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>