84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1008 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1266  hypothetical protein  38.2 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000976749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2316  hypothetical protein  35.8 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.401448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3017  hypothetical protein  34.66 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1797  ComEA-related protein  32.8 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00425429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1878  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins-like  33.51 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.137152  hitchhiker  0.0012387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  32.21 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  48.21 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1562  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  29.77 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  42.37 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.84 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.32 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  44.83 
 
 		 100 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.92281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2014  DNA uptake protein  35.82 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2037  hypothetical protein  48.21 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.98 
 
 		 296 aa  51.6  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  48 
 
 		 301 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2211  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.64 
 
 		 320 aa  51.2  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1113  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.24 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.560753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12460  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  42.86 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1521  late competence protein required for DNA binding and uptake  28.35 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.83 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.53 
 
 		 213 aa  47.8  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.58 
 
 		 545 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1611  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.86 
 
 		 278 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  29.11 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0773  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.81 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.466163  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1175  DNA uptake protein related DNA-binding protein  37.5 
 
 		 246 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000209814  hitchhiker  0.00000760392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2010  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  22.92 
 
 		 301 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  34.55 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.36 
 
 		 107 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.21 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  56.1 
 
 		 265 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1635  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.29 
 
 		 228 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12443  hypothetical protein  44.64 
 
 		 297 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  25.59 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.48 
 
 		 271 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.18 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  34.55 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  41.51 
 
 		 545 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  41.51 
 
 		 545 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1429  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0894635  hitchhiker  0.000989669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.14 
 
 		 225 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3498  hypothetical protein  40.91 
 
 		 101 aa  44.7  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0943  comEA protein  37.74 
 
 		 262 aa  44.3  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.17 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3093  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.88 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182901 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  34.11 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  50 
 
 		 90 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.17 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.93 
 
 		 114 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1944  DNA uptake protein related DNA-binding protein  35.59 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.727384  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38551  predicted protein  29.27 
 
 		 794 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2117  DNA uptake protein  30.99 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1813  DNA uptake protein  31.94 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  30.99 
 
 		 543 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2830  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.66 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.919156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0407  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40 
 
 		 131 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000244274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.18 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.62 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.62 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0313  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.23 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0283813  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1287  DNA uptake protein and related DNA-binding protein  35.71 
 
 		 306 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2104  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.71 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  38.18 
 
 		 116 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2047  DNA uptake protein  30.99 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0755007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4318  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.38 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3470  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.3 
 
 		 104 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.6047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1202  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.98 
 
 		 242 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5823  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.06 
 
 		 158 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1766  competence protein ComEA  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0368807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3915  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.5 
 
 		 269 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.67 
 
 		 587 aa  41.2  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12930  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  45.65 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.29 
 
 		 263 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0963672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0962  DNA uptake protein or related DNA-binding protein  34.55 
 
 		 109 aa  41.2  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3189  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.5 
 
 		 286 aa  41.2  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  39.29 
 
 		 267 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3525  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.29 
 
 		 267 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3593  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.29 
 
 		 267 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.09 
 
 		 93 aa  40.8  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>