267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0928 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  81.76 
 
 		 296 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  58.82 
 
 		 279 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  59.83 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  57.98 
 
 		 279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  56.56 
 
 		 310 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  56.43 
 
 		 285 aa  258  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  56.02 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  60.63 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  62.14 
 
 		 568 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  62.14 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  60.18 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  62.44 
 
 		 281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  62.44 
 
 		 281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  60.18 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  62.44 
 
 		 281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  62.44 
 
 		 281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  62.44 
 
 		 281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  60.18 
 
 		 281 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  57.56 
 
 		 281 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  62.62 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  63.55 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  63.55 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  55.84 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  55.05 
 
 		 236 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  56.6 
 
 		 235 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  57.62 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  58.13 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  54.59 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  56.59 
 
 		 237 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  54.03 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  53.67 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  44.79 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  52.86 
 
 		 237 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  48.55 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  52.48 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  51.22 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  54.81 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  54.81 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  51.92 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  44.26 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  46.97 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  46.97 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  49.51 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  48.94 
 
 		 429 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  44.64 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  44.02 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  42.5 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  43.29 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  49.29 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 		 419 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 		 432 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  44.05 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  49.74 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  49.74 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  49.74 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  49.74 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  48.7 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  49.74 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  49.74 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  49.74 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  49.74 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  43.67 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  41.88 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  41.15 
 
 		 438 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  48.45 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  44.02 
 
 		 420 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  44.13 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  41.07 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  42.67 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  44.34 
 
 		 407 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  41.03 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  44.87 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  42.67 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  45.25 
 
 		 403 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  43.1 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  41.18 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  45.26 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  38.21 
 
 		 380 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  46.91 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  48.69 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  48.69 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  48.69 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  48.69 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  48.69 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  41.88 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  39.74 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  47.74 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  39.74 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  41.45 
 
 		 405 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  41.88 
 
 		 405 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  39.91 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  46.7 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>