More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0343 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
273 aa  554  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2811  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.22 
 
 
254 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481066  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3659  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.18 
 
 
251 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2420  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.68 
 
 
269 aa  271  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.79 
 
 
278 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1011  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.41 
 
 
259 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2942  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.98 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2691  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.85 
 
 
267 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1018  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.98 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.98 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1171  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.98 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1657  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.98 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0975  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.87 
 
 
251 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2224  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.02 
 
 
269 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2684  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.43 
 
 
269 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2230  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.79 
 
 
255 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5801  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.35 
 
 
249 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0785741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0819  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.14 
 
 
257 aa  265  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2387  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.71 
 
 
249 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0824  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.56 
 
 
252 aa  262  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350857  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.29 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2470  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.29 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.29 
 
 
249 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2475  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.86 
 
 
249 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0998  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.36 
 
 
267 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.55 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.37 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
281 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
281 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
277 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
278 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
253 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
253 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.31 
 
 
271 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.5 
 
 
273 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
276 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
276 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.26 
 
 
277 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.68 
 
 
273 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3285  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.26 
 
 
261 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.53 
 
 
258 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  44.81 
 
 
464 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
276 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.72 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.6 
 
 
269 aa  165  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.57 
 
 
475 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.97 
 
 
247 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.5 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.5 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1710  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.75 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  41.83 
 
 
477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.35 
 
 
250 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.48 
 
 
245 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  41.83 
 
 
478 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
246 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.16 
 
 
487 aa  162  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.67 
 
 
246 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.17 
 
 
276 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.32 
 
 
464 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
245 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
266 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.28 
 
 
246 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.67 
 
 
246 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  43.15 
 
 
464 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.38 
 
 
245 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.08 
 
 
481 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.38 
 
 
277 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  41.56 
 
 
465 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.33 
 
 
245 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  42.04 
 
 
465 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  42.02 
 
 
485 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2965  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.03 
 
 
259 aa  158  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
258 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.8 
 
 
462 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
258 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.62 
 
 
260 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.25 
 
 
266 aa  156  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.06 
 
 
503 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1899  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.33 
 
 
247 aa  156  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  40.73 
 
 
275 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0115  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
244 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
463 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
478 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
463 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.75 
 
 
503 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.59 
 
 
277 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
521 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
463 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 
464 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.66 
 
 
478 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.65 
 
 
462 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.32 
 
 
506 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.57 
 
 
464 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.37 
 
 
272 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.7 
 
 
261 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.08 
 
 
528 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
259 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.87 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>