More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1269 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 258 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1710  uroporphyrin-III C-methyltransferase  66.93 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2965  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  63.18 
 
 		 259 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0260792  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.75 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.62 
 
 		 478 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.18 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 		 478 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  46.53 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.32 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 		 283 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.75 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.4 
 
 		 484 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.83 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.21 
 
 		 479 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  45.49 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.02 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.62 
 
 		 470 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.9 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50 
 
 		 480 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3285  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.2 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3770  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.17 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  44.35 
 
 		 473 aa  194  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  44.35 
 
 		 473 aa  194  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.44 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  44.35 
 
 		 470 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.24 
 
 		 475 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.75 
 
 		 482 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.8 
 
 		 521 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.35 
 
 		 487 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.67 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  45 
 
 		 459 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.67 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.67 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  44.86 
 
 		 467 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.93 
 
 		 472 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 		 464 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  48.59 
 
 		 477 aa  192  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.848441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  48.59 
 
 		 478 aa  191  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  43.46 
 
 		 462 aa  190  2e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.03 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.26 
 
 		 481 aa  188  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.93 
 
 		 462 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  44.17 
 
 		 459 aa  188  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.44 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.19 
 
 		 464 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.38 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.46 
 
 		 490 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 		 480 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  44.35 
 
 		 464 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  46.75 
 
 		 485 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  41.84 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  44.35 
 
 		 464 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.68 
 
 		 502 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  43.75 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.74 
 
 		 458 aa  185  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  43.48 
 
 		 465 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 		 480 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  43.8 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2488  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.58 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  45.19 
 
 		 457 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  43.1 
 
 		 474 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.69 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.22 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.22 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 		 528 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.33 
 
 		 463 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.33 
 
 		 463 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  44.77 
 
 		 457 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  44.77 
 
 		 457 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  44.77 
 
 		 457 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  44.77 
 
 		 459 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.88 
 
 		 554 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  43.15 
 
 		 468 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.11 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  44.77 
 
 		 457 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.35 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  46.61 
 
 		 493 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 		 490 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  42.62 
 
 		 472 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.59 
 
 		 479 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.26 
 
 		 464 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.15 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>