More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1072 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1072  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 123 aa  253  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.657739  normal  0.0829774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  89.83 
 
 		 437 aa  214  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  72.03 
 
 		 436 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  72.03 
 
 		 436 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  72.03 
 
 		 436 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  72.03 
 
 		 436 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  72.03 
 
 		 436 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  72.03 
 
 		 436 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  69.49 
 
 		 436 aa  166  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 436 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 436 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 436 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 436 aa  166  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 436 aa  166  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 436 aa  166  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 436 aa  166  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 455 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  69.49 
 
 		 434 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  68.64 
 
 		 434 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  70.59 
 
 		 462 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  67.24 
 
 		 434 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  66.1 
 
 		 433 aa  158  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  64.71 
 
 		 449 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  66.38 
 
 		 434 aa  156  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  64.71 
 
 		 445 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  63.03 
 
 		 446 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  62.71 
 
 		 439 aa  153  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  62.18 
 
 		 440 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  64.41 
 
 		 449 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6768  recombination factor protein RarA  62.71 
 
 		 434 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0179  recombination factor protein RarA  69.23 
 
 		 437 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.88179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  67.29 
 
 		 435 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  65.74 
 
 		 432 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  66.36 
 
 		 427 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  68.52 
 
 		 443 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  67.29 
 
 		 453 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  67.31 
 
 		 442 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  67.29 
 
 		 437 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  67.29 
 
 		 437 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  61.98 
 
 		 437 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  66.35 
 
 		 447 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  63.33 
 
 		 474 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  63.06 
 
 		 435 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  62.96 
 
 		 442 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  61.82 
 
 		 430 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  57.02 
 
 		 444 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  57.76 
 
 		 441 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  59.48 
 
 		 441 aa  135  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  57.76 
 
 		 441 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  57.76 
 
 		 441 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  58.62 
 
 		 441 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  61.82 
 
 		 442 aa  135  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  57.76 
 
 		 441 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  58.62 
 
 		 441 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  58.62 
 
 		 440 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  57.76 
 
 		 440 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  56.3 
 
 		 441 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  56.9 
 
 		 440 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  52.07 
 
 		 455 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  49.6 
 
 		 436 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  53.27 
 
 		 453 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  49.14 
 
 		 447 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  55 
 
 		 443 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  55 
 
 		 443 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  62.04 
 
 		 452 aa  124  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  53.85 
 
 		 435 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 443 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 443 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 443 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 443 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 443 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 443 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 442 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  56.07 
 
 		 444 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 445 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  46.55 
 
 		 432 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  53.27 
 
 		 461 aa  120  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  53.27 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  55.14 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  54.21 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  54.46 
 
 		 447 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  54.46 
 
 		 447 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  50.83 
 
 		 443 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  51.85 
 
 		 455 aa  118  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  55.45 
 
 		 446 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  54.46 
 
 		 447 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  55.14 
 
 		 451 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  53.98 
 
 		 442 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  55.14 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  54.21 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>